昆明医科大学审计处于2020年独立设置，前身是昆明医科大学监察审计处。学校审计工作以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面贯彻党中央国务院决策部署，紧紧围绕统筹推进“五位一体”总体布局和协调推进“四个全面”战略布局。在学校主要领导和党委审计委员会的领导下开展工作。目前，审计处内设经济责任审计科和基建项目审计科两个科室，共有4名审计人员，其中高级职称2人。

审计处作为学校治理结构中重要的组成部分，在坚持党对审计工作的集中统一领导下，紧紧围绕内部审计工作目标和职能定位，坚持“防未病、治既病、强体系”，坚持寓监督于服务之中，发挥“免疫系统”功能，促进学校完善治理，实现高质量发展的目标。

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