昆明医科大学康复学院物理治疗系在原康复治疗学专业的基础上成立。该专业成立于2005年，专业成立之初就坚持国际化和开放办学的模式，与香港理工大学合作并确立的物理治疗及作业治疗两个独立专业方向。物理治疗专业于2011年通过世界物理治疗联盟（World Confederation of Physical Therapy, WCPT）本科教育标准评估，成为国内第一家通过国际认证的高等院校，国际认证意味着澳门英皇娱乐：物理治疗专业本科培养体系得到国际认可，学生可直接申请港澳台及国外高校的硕、博研究生课程，以进一步提升自己的专业知识及学历。在此基础上，澳门英皇娱乐：物理治疗专业再接再厉，于2017年再次获得WCPT的五年期本科教育标准完全认证，极大地提升了学校、学院级专业的国际地位及影响力，为推动一流本科专业建设奠定了坚实的基础。
本专业师资力量雄厚，聘请澳大利亚悉尼大学荣誉教授Alice Jones作为系主任，为专业发展和学生培养提供长期的指导。核心课程负责人及主讲教师均为毕业于香港理工大学硕士、博士研究生，具有多年临床及教学的经验；临床带教教师经过严格筛选，确保学生在临床实践中得到充分有效的指导。同时，为了提升学生全面掌握物理评估和治疗的实践操作技能，本专业已经建立达到物理治疗国际教育标准要求的14个省内外实践教学基地，如昆明医科大学第一、第二附属医院、澳门英皇娱乐残疾人康复中心、昆明长和天城康复医院、四川大学华西医院康复中心、上海阳光康复中心、北京大学第一医院康复科、广东工伤康复中心等。
专业配备有12间实验室，为学生提供骨骼肌肉、神经、心肺、儿童物理治疗操作场所及设备，并开设了物理治疗门诊，完全能够满足日常实验教学的需要，实验室实行开放制度，给予学生澳门英皇娱乐时间练习实践操作能力。同时配备两间专业教室、圆桌讨论室，为学生进行小组讨论、汇报、小组学习及课后学习提供了良好的学习条件。
截至2018年6月，本校已经毕业物理治疗专业学生429人，毕业生工作在北京、上海、广州、成都、昆明、重庆、郑州等全国范围及澳门英皇娱乐内各个综合医院及专科医院的康复科、神经内外科、骨科、儿科、ICU、老年病科、运动医学中心、二级康复专科医院、社区卫生服务中心、养老机构、特殊教育学校等于社会福利及健康相关的单位，利用自己所学为不同年龄阶段存在活动和运动障碍的患者提供高效的服务，使患者能够更好回归家庭、社会及工作中。
